一、合同備案基本程序：
經(jīng)貿(mào)部門(mén)審批
--> 向海關(guān)服務(wù)中心購(gòu)買(mǎi)空白《登記手冊(cè)》
--> 合同預(yù)錄入
--> 海關(guān)審核后開(kāi)具《開(kāi)設(shè)保證金臺(tái)帳聯(lián)系單》
--> 向中國(guó)銀行申請(qǐng)?jiān)O(shè)立臺(tái)帳 ---> 海關(guān)核注銀行簽發(fā)的《臺(tái)帳登記通知單》
--> 海關(guān)進(jìn)行計(jì)算機(jī)異地傳輸 ---> 收到傳輸成功回執(zhí)后核發(fā)《登記手冊(cè)》。
二、合同備案所需單證：
1、經(jīng)營(yíng)單位申請(qǐng)報(bào)告。
2、外經(jīng)貿(mào)主管部門(mén)《批準(zhǔn)證》，屬于進(jìn)料加工的需要加蓋稅務(wù)部門(mén)印章。
3、對(duì)外簽訂的進(jìn)出口合同。
4、經(jīng)營(yíng)單位基本帳戶(hù)開(kāi)立證明。
5、加工企業(yè)所在地經(jīng)貿(mào)部門(mén)出具的《加工生產(chǎn)能力證明》。
6、委托加工應(yīng)提供經(jīng)營(yíng)單位與加工企業(yè)簽定的符合《中華人民共和國(guó)合同法》的委托加工合同（協(xié)議）。
7、開(kāi)展異地加工貿(mào)易，須提供經(jīng)營(yíng)單位所在地海關(guān)出具的關(guān)封，內(nèi)含《異地加工申請(qǐng)表》一式二份。
8、首次開(kāi)展加工貿(mào)易須提供經(jīng)營(yíng)單位和加工企業(yè)的《營(yíng)業(yè)執(zhí)照》、《稅務(wù)登記證》復(fù)印件及《海關(guān)登記通知書(shū)》。
9、經(jīng)營(yíng)單位的介紹信或委托書(shū)。
10、加工工藝說(shuō)明。
11、如需異地口岸進(jìn)出口報(bào)關(guān)，須填寫(xiě)《異地報(bào)關(guān)申請(qǐng)表》。
12、海關(guān)需要的其他資料。
注：1）海關(guān)對(duì)首次開(kāi)展加工貿(mào)易的企業(yè)實(shí)行驗(yàn)廠制度；對(duì)單證齊全、驗(yàn)廠合格的企業(yè)，海關(guān)在3個(gè)工作日內(nèi)核發(fā)《登記手冊(cè)》。
2）辦理加工貿(mào)易合同備案的企業(yè)屬AA類(lèi)的，免設(shè)臺(tái)帳；屬A類(lèi)企業(yè)的，需設(shè)臺(tái)帳，實(shí)行“空轉(zhuǎn)”；屬B類(lèi)企業(yè)的，需設(shè)臺(tái)帳，一般商品實(shí)行“空轉(zhuǎn)”，限制類(lèi)商品實(shí)行“實(shí)轉(zhuǎn)”；屬C類(lèi)企業(yè)的，需設(shè)臺(tái)帳，一律實(shí)行“實(shí)轉(zhuǎn)”；D類(lèi)企業(yè)不得開(kāi)展加工貿(mào)易業(yè)務(wù)。經(jīng)營(yíng)單位與加工企業(yè)非同一分類(lèi)的，海關(guān)按就低不就高的原則管理。對(duì)外商提供的進(jìn)口輔料品種在規(guī)定范圍內(nèi)，且金額在5000美金以下的，免辦手冊(cè)，不納入臺(tái)帳管理。
三、辦理5000美元以下78種客供輔料備案手續(xù)所需單證：
1、申請(qǐng)報(bào)告。
2、進(jìn)口發(fā)票、裝箱單（一式二份）。
3、出口合同（一式二份）。
4、經(jīng)營(yíng)單位介紹信或委托書(shū)。
四、合同核銷(xiāo)
（一）基本流程：
合同執(zhí)行完畢后一個(gè)月內(nèi)企業(yè)向海關(guān)申請(qǐng)核銷(xiāo)
--> 預(yù)錄入
--> 海關(guān)審核
--> 簽發(fā)《臺(tái)帳核銷(xiāo)聯(lián)系單》
--> 中國(guó)銀行銷(xiāo)帳
--> 海關(guān)核銷(xiāo)結(jié)案
--> 打印結(jié)案通知書(shū)。
注：企業(yè)必須在海關(guān)規(guī)定的期限內(nèi)向海關(guān)辦理核銷(xiāo)手續(xù)。對(duì)無(wú)正當(dāng)理由未向海關(guān)辦理核銷(xiāo)手續(xù)的，海關(guān)根據(jù)有關(guān)規(guī)定進(jìn)行處罰。
（二）所需單證
1、經(jīng)營(yíng)單位申請(qǐng)核銷(xiāo)報(bào)告。
2、進(jìn)出口報(bào)關(guān)單。
3、《登記手冊(cè)》。
4、海關(guān)需要的其他單證，如核算表、劃料圖等反映實(shí)際加工情況的資料。
五、合同變更和展期
（一）基本流程：
經(jīng)貿(mào)部門(mén)審批
--> 向海關(guān)服務(wù)中心變更預(yù)錄入
--> 海關(guān)審核
--> 簽發(fā)《臺(tái)帳變更聯(lián)系單》
--> 中國(guó)銀行臺(tái)帳回執(zhí)
--> 異地傳輸
--> 傳輸成功后打印合同變更審批表。
（二）所需單證
1、填寫(xiě)《合同變更申請(qǐng)表》或《合同延期申請(qǐng)表》，加蓋經(jīng)營(yíng)單位公章。
2、變更、延期的合同。
3、外經(jīng)貿(mào)主管部門(mén)的批準(zhǔn)文件。
4、《登記手冊(cè)》。
5、申請(qǐng)報(bào)告及海關(guān)需要的其他單證。
備注：對(duì)貿(mào)易性質(zhì)不變、商品品種不變、合同變更金額小于1萬(wàn)美元（含1萬(wàn)美元）和按原審批合同延長(zhǎng)加工期限不超過(guò)三個(gè)月的合同，直接到海關(guān)和中行辦理變更手續(xù)，不再經(jīng)外經(jīng)貿(mào)易部門(mén)重新審批。合同展期應(yīng)在《登記手冊(cè)》有效期內(nèi)向海關(guān)申請(qǐng)。
六、保稅倉(cāng)庫(kù)貨物管理
（一）入庫(kù)貨物應(yīng)提供單證：
1、企業(yè)申請(qǐng)報(bào)告。
2、存入貨物的合同。
3、發(fā)票、裝箱單。
4、保稅倉(cāng)庫(kù)貨物審批表。
（二）出庫(kù)貨物應(yīng)提供單證：
1、登記手冊(cè)。
2、企業(yè)申請(qǐng)報(bào)告。
3、進(jìn)口報(bào)關(guān)單。
4、保稅倉(cāng)庫(kù)貨物提取審批表。
（三）辦理程序：
填寫(xiě)《保稅倉(cāng)庫(kù)貨物入（出）審批表》
─→海關(guān)審批
─→簽發(fā)《保稅倉(cāng)庫(kù)貨物入（出）庫(kù)單》
─→貨主憑單辦理報(bào)關(guān)手續(xù)。
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